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Publications

(+: equal contribution and *: co-corresponding authors if not noted specifically)

2023

  • Kang, M., Kim., S., Lee, D.-B., Hong, C.*, and Hwang, K.-B.*, Gene-specific machine learning for pathogenicity prediction of rare BRCA1 and BRCA2 missense variants, Scientific Reports, vol. 13, p. 10478, 2023.
  • 이다빈, 김선화, 강문종, 홍창범, 황규백, 심층 신경망과 랜덤포레스트를 이용한 유전암 관련 단일 염기 변이의 병원성 예측, 정보과학회논문지, 제50권, 제9호, pp. 746-750, 2023. (2022 한국컴퓨터종합학술대회 논문의 확장)
  • 이다빈, 김진석, 김보미, 장명도, 우정헌, 황규백, LASSO를 이용한 대한민국의 대기오염 물질 배출량에 따른 PM2.5 및 오존 농도 예측, 2023 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 1027-1029, 2023.

2022

2020

  • 이다빈, 황규백, 랜드마크 유전자 기반 목표 유전자 발현량 예측을 위한 특징 추출 심층 신경망, 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지, 제26권, 제8호, pp. 373-377, 2020. (2019 한국컴퓨터종합학술대회 논문의 확장)

2019

  • Hwang, K.-B.+, Lee, I.-H.+, Li, H., Won, D.-G., Hernandez-Ferrer, C., Negron, J.A., and Kong, S.W., Comparative analysis of whole-genome sequencing pipelines to minimize false negative findings, Scientific Reports, vol. 9, p. 3219, 2019.
  • Mun, D.-G.+, Bhin, J.+, Kim, S.+, Kim, H.+, Jung, J.H.+, Jung, Y., Jang, Y.E., Park, J.M., Kim, H., Jung, Y., Lee, H., Bae, J., Back, S., Kim, S.-J., Kim, J., Park, H., Li, H., Hwang, K.-B., Park, Y.S., Yook, J.H., Kim, B.S., Kwon, S.Y., Ryu, S.W., Park, D.Y., Jeon, T.Y., Kim, D.H., Lee, J.-H., Han, S.-U., Song, K.S., Park, D., Park, J.W., Rodriguez, H., Kim, J., Lee, H., Kim, K.P., Yang, E.G.*, Kim, H.K.*, Paek, E.*, Lee, S.*, Lee, S.-W.*, and Hwang, D.*, Proteogenomic characterization of human early-onset gastric cancer, Cancer Cell, vol. 35, no. 1, pp. 111-124, 2019.
  • 이다빈, 황규백, 랜드마크 유전자 기반 목표 유전자 발현량 예측을 위한 특징 추출 심층 신경망, 2019 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 814-816, 2019.
  • 유수정, 황규백, LSTM 오토인코더를 사용한 탠덤 질량 스펙트럼으로부터의 특징 추출, 2019 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 730-732, 2019.

2018

  • 김진의, 황규백, 비감독 기계학습을 이용한 단일 염기 다형성 기반 유전 집단 구조 시각화, 2018 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 750-752, 2018.
  • 이다빈, 황규백, 기계학습을 이용한 랜드마크 유전자 기반 표적 유전자 발현량 예측, 2018 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 753-755, 2018.
  • Autin Martineau, K. and Hwang, K.-B., Predicting gene expressions from gene expressions: comparison between lasso and random forest, 2018 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 744-746, 2018.

2017

  • Li, H.+, Park, J.+, Kim, H., Hwang, K.-B.*, and Paek, E.*, Systematic comparison of false-discovery-rate-controlling strategies for proteogenomic search using spike-in experiments, Journal of Proteome Research, vol. 16, no. 6, pp. 2231-2239, 2017.
  • 류단휘, 이다빈, 유수정, 황규백, 유전체 변이 정규화 소프트웨어의 비교 분석, 2017 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 722-724, 2017.
  • 이경문, 황규백, 선형 회귀 및 랜덤 포레스트를 이용한 개인 기록 기반 프로야구 선수 연봉 예측, 2017 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp.1842-1884, 2017.

2016

  • Li, H., Joh, Y.S., Kim, H., Paek, E., Lee, S.-W., and Hwang, K.-B., Evaluating the effect of database inflation in proteogenomic search on sensitive and reliable peptide identification, BMC Genomics (Proceedings of InCoB 2016), vol., 17, no. Suppl 13, p. 3327, 2016.
  • Rhee, J.-K., Li, H., Joung, J.-G., Hwang, K.-B., Zhang, B.-T., Shin, S.-Y., Survey of computational haplotype determination methods for single individual, Genes & Genomics, vol. 38, no. 1, pp. 1-12, 2016.
  • 이홍란, 류단휘, 이기욱, 황규백, 탠덤 질량 분석을 위한 디코이 데이터베이스 생성 방법의 중복성 관점에서의 성능 평가, 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지, 제22권, 제1호, pp. 56-60, 2016. (2015 한국컴퓨터종합학술대회 논문의 확장)
  • 이기욱, 원동건, 황규백, 로지스틱 회귀분석을 이용한 신규변이 여과 기법, 2016 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 827-829, 2016.
  • 류단휘, 이홍란, 황규백, 어셈블리 기반 삽입결실 변이 탐지 소프트웨어 도구의 비교 분석, 2016 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, pp. 830-832, 2016.

2015

2014

2013

2012

  • Park, S., Shin, S.-Y.*, and Hwang, K.-B.*, CFMDS: CUDA-based fast multidimensional scaling for genome-scale data, BMC Bioinformatics (Proceedings of InCoB 2012), vol. 13, no. Suppl 17, p. S23, 2012.
  • Song, T., Hwang, K.-B.*, Hsing, M., Lee, K., Bohn, J., and Kong, S. W.*, gSearch: a fast and flexible general search tool for whole-genome sequencing, Bioinformatics, vol. 28, no. 16, pp. 2176-2177, 2012.
  • 허민오, 강명구, 임병권, 황규백, 박영택, 장병탁, 확률 그래프 모델을 이용한 스마트폰 사용자의 이동경로 학습 및 실시간 예측 기법, 정보과학회논문지: 소프트웨어 및 응용, 제39권, 제6호, pp. 425-435, 2012. (한국정보과학회 2011 가을학술대회 논문의 확장)
  • 보티홍푸옹, 황규백, 개인 GPS 데이터 기반의 주요 장소 및 경로 학습, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제18권, 제2호, pp. 148-152, 2012. (2011 한국컴퓨터종합학술대회 논문의 확장)
  • 이홍란, 황규백, 확률그래프모델을 이용한 MS/MS 기반 단백질 동정 기법, 2012 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제39권, 제1호(B), pp. 426-428, 2012. 

2011

  • Seok, H.-S., Hwang, K.-B., and Zhang, B.-T., Feature relevance network-based transfer learning for indoor location estimation, IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics-Part C: Applications and Reviews, vol. 41, no. 5, pp. 711-719, 2011.
  • Kim, H.-J., Joo, H. J., Kim, Y. H., Ahn, S., Chang, J., Hwang, K.-B., Lee, D.-H., and Lee, K.-J., Systemic analysis of heat shock response induced by heat shock and a proteasome inhibitor MG132, PLoS ONE, vol. 6, no. 6, p. e20252, 2011.
  • Bong, S.-Y. and Hwang, K.-B., Keyphrase extraction in biomedical publications using MeSH and intraphrase word co-occurrence information, Proceedings of the ACM 5th International Workshop on Data and Text Mining in Biomedical Informatics, pp. 63-66, 2011.
  • 박경미, 황규백, 자연어처리 기반 바이오 텍스트 마이닝 시스템, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제17권, 제4호, pp. 205-213, 2011.
  • 허민오, 강명구, 임병권, 황규백, 장병탁, 확률 그래프 모델을 이용한 스마트폰 사용자의 이동경로 학습 및 실시간 예측 기법, 한국정보과학회 2011 가을 학술발표논문집, 제38권, 제2호(B), pp. 248-251, 2011.
  • 봉성용, 서인식, 김문식, 황규백, 맞춤형 광고를 위한 내용기반 영화 추천 기법, 2011 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제38권, 제1호(C), pp. 269-272, 2011.
  • Vo, P. and Hwang, K.-B., Prediction of routes between significant locations based on personal GPS data, 2011 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제38권, 제1호(A), pp. 278-281, 2011.
  • 봉성용, 황규백, MeSH 정보를 이용한 생물정보학 논문에서의 저자 주제어 추천 방법, 2011 한국 HCI 학술대회 논문집, pp. 236-238, 2011.
  • 서인식, 황규백, 맞춤형 광고를 위한 연령대별 영화 선호도 예측 기법, 2011 한국 HCI 학술대회 논문집, pp. 133-135, 2011.

2010

  • Ju, S., Lee, S., and Hwang, K.-B., Applying machine learning techniques to tag recommendation in social bookmarking systems, Information-An International Interdisciplinary Journal, vol. 13, no. 5, pp. 1613-1624, 2010.
  • Shin, J., Joo, S., Hwang, K.-B., Lee, S., and Park, J., Locality-based peer clustering for efficient overlay networks, Information-An International Interdisciplinary Journal, vol. 13, no. 3(A), pp. 657-665, 2010.
  • Soon, L.-K., Hwang, K.-B., and Lee, S. H., An empirical study on harmonizing classification precision using IE patterns, Proceedings of the 2nd International Conference on Software Engineering and Data Mining (SEDM 2010), pp. 251-256, 2010.
  • 박성인, 황규백, CUDA 및 분할-정복 기반의 효율적인 다차원 척도법, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제16권, 제4호, pp. 427-431, 2010. (한국정보과학회 2009 가을학술대회 논문의 확장)
  • 박경미, 황규백, 절 경계와 트리 거리를 사용한 2단계 부분 의미 분석 시스템, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제16권, 제5호, pp. 531-540, 2010.
  • 황규백, 봉성용, 구현서, 백은옥, 마코프 논리 기반의 시맨틱 문서 검색, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제16권, 제6호, pp. 663-667, 2010. (한국정보과학회 2009 가을학술대회 논문의 확장)
  • 서인식, 황규백, 확장 키워드 매칭을 이용한 영화 장르 별 광고 카테고리 추천, 2010 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제37권, 제1호(A), pp. 138-139, 2010.
  • 봉성용, 황규백, Labeled LDA를 이용한 저자 주제어 추천, 2010 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제37권, 제1호(C), pp. 385-389, 2010.

2009

  • Ju, S. and Hwang, K.-B., A weighting scheme for tag recommendation in social bookmarking systems, Proceedings of ECML PKDD Discovery Challenge 2009 (DC09), vol. 497, pp.109-118, 2009. (ranked 3rd in task #1 of the competition)
  • 김찬주, 황규백, 소셜 북마킹 시스템의 스패머 자동 탐지를 위한 기계학습 기술의 성능 비교, 정보과학회논문지: 컴퓨팅의 실제 및 레터, 제15권, 제5호, pp. 345-349, 2009. (한국정보과학회 2008 가을학술대회 논문의 확장)
  • 하범용, 김상수, 황규백, 서열 자질 및 발현 정보에 기반한 효모의 필수유전자 예측, 한국정보과학회 2009 가을 학술발표논문집, 제36권, 제2호(A), pp. 44-45, 2009.
  • 황규백, 봉성용, 구현서, 백은옥, 마코프 논리 기반의 시맨틱 문서 검색, 한국정보과학회 2009 가을 학술발표논문집, 제36권, 제2호(A), pp. 110-111, 2009.
  • 박성인, 황규백, 대규모 데이터를 위한 CUDA 및 분할-정복 접근법 기반의 효율적인 다차원 척도법, 한국정보과학회 2009 가을 학술발표논문집, 제36권, 제2호(A), pp. 114-115, 2009.
  • 주상훈, 황규백, 로지스틱 회귀분석을 이용한 소셜 북마킹 시스템의 태그 추천 기법, 한국정보과학회 2009 가을 학술발표논문집, 제36권, 제2호(C), pp. 338-341, 2009.
  • 박성인, 황규백, CUDA 기반의 효율적인 전통 다차원 척도법 구현, 2009 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제36권, 제1호(C), pp. 407-411, 2009.
  • 김찬주, 정재연, 박래웅, 신수용, 조성원, 황규백, 래퍼 기반의 자질 선정 및 과대표집을 통한 불균형 간경변증 데이터 분류, 2009 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제36권, 제1호(A), pp. 145-146, 2009.

2008

  • Kim, C. and Hwang, K.-B., Naive Bayes classifier learning with feature selection for spam detection in social bookmarking, Proceedings of ECML PKDD Discovery Challenge 2008 (DC08), 2008. (ranked 3rd in task #1 of the competition)
  • 김두혁, 황규백, 은닉마코프모델과 강건한 분산 추정량을 이용한 실내 위치추정, 한국정보과학회 2008 가을 학술발표논문집, 제35권, 제2호(C), pp. 311-315, 2008.
  • 김찬주, 황규백, 소셜 북마킹 시스템의 스패머 자동 탐지를 위한 기계학습 기술의 성능 비교, 한국정보과학회 2008 가을 학술발표논문집, 제35권, 제2호(A), pp. 107-108, 2008.
  • 석호식, 황규백, 장병탁, AP 관계성 분석을 통한 위치 추정, 한국정보과학회 2008 가을 학술발표논문집, 제35권, 제2호(C), pp. 302-305, 2008.
  • 김두혁, 김찬주, 황규백, 놈(Norm)에 따른 k-최근접 이웃 학습의 성능 변화, 2008 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제35권, 제1호(C), pp. 371-375, 2008.
  • 전광성, 황규백, 대규모 데이터를 위한 k-최근접 이웃 학습 기반의 효율적인 협력적 여과 기법, 2008 한국컴퓨터종합학술대회 논문집, 제35권, 제1호(C), pp. 376-380, 2008.

2007

  • Joung, J.-G., Hwang, K.-B., Nam, J.-W., Kim, S.-J., and Zhang, B.-T., Discovery of microRNA-mRNA modules via population-based probabilistic learning, Bioinformatics, vol. 23, no. 9, pp. 1141-1147, 2007.
  • Nam, J.-W., Lee, I.-H., Hwang, K.-B., Park, S.-B., and Zhang, B.-T., Dinucleotide step parameterization of pre-miRNAs using multi-objective evolutionary algorithms, Lecture Notes in Computer Science (Proceedings of EvoBio 2007), vol. 4447, pp.176-186, 2007.
  • 황규백, 강건한 연관검색어 추출 알고리즘 개발: 복잡망의 위상적 특질을 고려한 검색어 간 연관관계의 구분, 기술보고서 SSUMLLAB-TR-2007-01, 2007.
  • 황규백, 정제균, 남진우, 김병희, 이제근, 장병탁, 바이오데이터 분석을 위한 기계학습 기술, 정보과학회지, 제25권, 제3호, pp. 35-45, 2007.

2006

  • Kang, S.-S. and Hwang, K.-B., A language independent n-gram model for word segmentation, Lecture Notes in Artificial Intelligence (Proceedings of AJCAI 2006), vol. 4304, pp. 557-565, 2006.
  • Hwang, K.-B., Kim, B.-H., and Zhang, B.-T., Learning hierarchical Bayesian networks for large-scale data analysis, Lecture Notes in Computer Science (Proceedings of ICONIP 2006), vol. 4232, pp. 670-679, 2006.
  • Lim, D.-H., Hwang, K.-B., and Kang, S.-S., N-gram based two-step algorithm for word segmentation, Proceedings of the Fifth SIGHAN Workshop on Chinese Language Processing, pp. 197-200, 2006. 

Before 2006 (selected)

  • Hwang, K.-B. and Zhang, B.-T., Bayesian model averaging of Bayesian network classifiers over multiple node-orders: application to sparse datasets, IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics-Part B: Cybernetics, vol. 35, no. 6, pp. 1302-1310, 2005.
  • Kong, S. W.+, Hwang, K.-B.+, Kim, R. D., Zhang, B.-T., Greenberg, S. A., Kohane, I. S., and Park, P. J., CrossChip: a system supporting comparative analysis of different generations of Affymetrix arrays, Bioinformatics, vol. 21, no. 9, pp. 2116-2117, 2005.
  • Chang, J.-H., Hwang, K.-B., O, S. J., and Zhang, B.-T, Bayesian network learning with feature abstraction for gene-drug dependency analysis, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol. 3, no. 1, pp. 61-77, 2005.
  • Hwang, K.-B.+, Kong, S. W.+, Greenberg, S. A., and Park, P. J., Combining gene expression data from different generations of oligonucleotide arrays, BMC Bioinformatics, vol. 5, p. 159, 2004.
  • Zhang, B.-T. and Hwang, K.-B., Bayesian network classifiers for gene expression analysis, A Practical Approach to Microarray Data Analysis, Berrar, D.P., Dubitzky, W., and Granzow, M. (eds.), pp. 150-165, Kluwer Academic Publishers, 2003.
  • Hwang, K.-B., Lee, J. W., Chung, S.-W., and Zhang, B.-T., Construction of large-scale Bayesian networks by local to global search, Lecture Notes in Artificial Intelligence (Proceedings of PRICAI 2002), vol. 2417, pp. 375-384, 2002.
  • Chang, J.-H., Hwang, K.-B., and Zhang, B.-T., Analysis of gene expression profiles and drug activity patterns by clustering and Bayesian network learning, Methods of Microarray Data Analysis II (Proceedings of CAMDA 2001), Lin, S.M. and Johnson, K.F. (eds.), pp. 169-184, Kluwer Academic Publishers, 2002.
  • Hwang, K.-B., Cho, D.-Y., Park, S.-W., Kim, S.-D., and Zhang, B.-T., Applying machine learning techniques to analysis of gene expression data: cancer diagnosis, Methods of Microarray Data Analysis (Proceedings of CAMDA 2000), Lin, S.M. and Johnson, K.F. (eds.), pp. 167-182, Kluwer Academic Publishers, 2002.
  • Kim, Y. S., Kim, S. D., Park, S. B., Lee, J. W., Chang, J. H., Hwang, K. B., O, J. M., and Kim, Y. T., Machine translation systems: E-K, K-E, J-K, K-J, Lecture Notes in Artificial Intelligence (Proceedings of AMTA 2000), vol. 1934, pp. 248-252, 2000.